Торжественное открытие Нерехтского краеведческого музея произошло 14 мая 1975 года. Он разместился в здании бывшей «частной аптеки», построенной в начале XX века в стиле «модерн» по ул. Володарского, д. 9. Первыми заведующими музеем стали Иван Федорович Ревин и Елизавета Васильевна Ерофеева. В основу коллекций были положены предметы, собранные краеведческим кружком при Доме пионеров, возглавлял который Игорь Георгиевич Большаков.
В 1980-е гг. в Нерехте начинается реставрация храмов. Вдохновителем реставрационных работ стала Н.П. Родионова – заведующий Нерехтским филиалом, который она возглавила в 1983 году. В ходе реставрационных работ музей сумел объединить вокруг себя всех, кто мечтал о возрождении родного города. В это время происходило формирование музея как культурно-духовного центра Нерехты. По окончании реставрационного марафона он расположился в 2-х храмах – Никольском (ц. Богоявления) и Варваринском (ц. Воскресения), Казанской колокольне и в здании бывшей «частной аптеки». В 1997 году по решению губернатора Костромской области В.А. Шершунова в городе при музее создан духовно-культурный центр «Дорога к храму».
В 2004 году в Нерехтском краеведческом музее открылась экспозиция «Нерехта. Одна из многих…» (по «Дневнику русской женщины» Е.А. Дьяконовой). В 2005 году музей был награжден Дипломом и специальным призом жюри фестиваля в Москве «Интермузей-2005» «За лучшую презентацию на фестивале проекта «Нерехта. Одна из многих…». Также в 2004 году губернатором Костромской области В.А. Шершуновым было принято решение о передаче здания «Ансамбля Брюхановской больницы» (ул. Восход, д. 3) Нерехтскому краеведческому музею. И, спустя 10 лет, 2 августа 2014 г. прошло торжественное открытие нового музейного объекта - «Ансамбля Брюхановской больницы», приуроченное к 800-летию Нерехты. Реставрация проводилась под патронажем губернатора Костромской области Сергея Константиновича Ситникова.
В 2009 году на должность заведующего Нерехтским краеведческим музеем была назначена Ольга Михайловна Майорова. В 2017 году на музейном Варварином подворье был открыт Музей Мечты в честь первого полета на воздушном шаре в 1731 году «нерехтца» Ефима Крякутного. В этом же году Нерехтскому краеведческому музею – филиалу ОГБУК «Костромской государственный историко-архитектурный и художественный музей-заповедник» присвоено имя выдающегося земляка, заслуженного работника культуры Нины Петровны Родионовой.
Более 40 лет музей продолжает собирать архивы об истории края, купеческих родах, предпринимателях, благотворителях, нерехтчанах-подвижниках дел государевых, первопроходцах, людях, творящих историю, о талантах и мастерах земли нерехтской. В фондах музея находятся уникальные коллекции музейных предметов: гончарной посуды, нерехтских шалей и платков, старопечатной книги, церковного облачения, самоваров, утюгов, сундуков и др (всего более 12 тыс. ед. хр.).
Нерехтский краеведческий музей им. Н.П. Родионовой в настоящее время представляет собой целый музейный комплекс, включающий в себя:
1. «Ансамбль Брюхановской больницы» (ул. Восход, д. 3) - красивое краснокирпичное здание в стиле модерн, украшенное майоликовыми плитками фиолетового и малахитового цветов, построенное в начале XX века нерехтским фабрикантом К.А. Брюхановым. В этом здании размещаются временные выставки музея.
2. Здание «частной аптеки» (ул. Володарского, д. 9) – строение начала XX века, оформленное в стиле модерн. В настоящее время в музее представлена экспозиция «Нерехта. Одна из многих...», по «Дневнику русской женщины» Е.А. Дьяконовой (1874 - 1902 гг.) - нерехтчанки, купеческой дочки, студентки юридического факультета Сорбонны в Париже.
3. Никольский храм-музей (ул. Володарского, д. 1а) – был построен в 1710-1725 гг. на средства нерехтских купцов. В трапезной и четверике перед вами предстает возрожденная красота православного храма, уникальная фресковая живопись XVIII века ярославских и костромских мастеров, золоченые иконостасы XIX века, экспозиция «Откровение старых церковных книг XVII-XIX вв.».
4. Музей Мечты, посвящённый нашему земляку-первому воздухоплавателю Ефиму Крякутному (ул. Пионерская, д. 1а). В этом музее вы познакомитесь со сказками и легендами, герои которых осуществили свою мечту о полете. Узнаете о реальных попытках русских «икаров» подняться в небо, познакомитесь с историей воздухоплавания, окунетесь в атмосферу времени, в котором жил простой «чудак» из Нерехты – Ефимка Крякутной.